Existen distintos criterios para clasificar a las bacterias,
Según la respiración:
- Bacterias aerobias: para respirar, este tipo de bacterias se valen del oxígeno.
- Bacterias anaerobias: estas, en cambio, no utilizan oxígeno, sino que deben sustituirlo por moléculas inorgánicas como las del sulfato o carbonato.
Según sus necesidades de crecimiento:
- Bacterias autótrofas: estas bacterias tienen la capacidad de sintetizar las sustancias que necesitan para su metabolismo de sustancias inorgánicas.
- Bacterias heterótrofas: este tipo de bacterias parasitan a los seres vivos y usan los compuestos orgánicos que estos elaboran. Dentro de este grupo existen las bacterias patógenas o parásitarias
Según su forma:
- Cocos: estas, también conocidas como bacterias redondeadas, pueden hallarse de forma aislada,
- Leptothrix: son bacterias que las conforman filamentos tabicados y su tamaño es grande.
- Bacilos: son alargadas, curvas o rectas y pueden o no poseer flagelos.
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